用于自動(dòng)檢測(cè)和分離單細(xì)胞和克隆的軟件——用戶友好,功能強(qiáng)大
CellCelector 是一個(gè)靈活且多功能的系統(tǒng),用于自動(dòng)分析和挑取單細(xì)胞和克隆。因此,需要一個(gè)同樣靈活且強(qiáng)大的軟件來(lái)獲取CellCelector 的眾多功能。
直觀易用的圖形用戶界面可指導(dǎo)操作者完成每一步實(shí)驗(yàn)。不同的用戶訪問(wèn)級(jí)別既允許允許新操作員在不接受強(qiáng)化培訓(xùn)的情況下輕松訪問(wèn)軟件,同時(shí)又為超級(jí)用戶提供高級(jí)功能、對(duì)所有參數(shù)的開(kāi)放訪問(wèn)、校準(zhǔn)和自定義功能。這使得簡(jiǎn)單的日常使用以及執(zhí)行復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)成為可能。
CellCelector軟件的用戶界面通過(guò)將實(shí)驗(yàn)分為5個(gè)不同的步驟,與標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)工作流程保持一致:
- 掃描細(xì)胞培養(yǎng)板和培養(yǎng)皿,以采集和記錄所有所需通道(明場(chǎng)、相差和熒光)中的圖像
- 分析這些圖像并檢測(cè)感興趣的細(xì)胞或克隆
- (可選)操作人員進(jìn)行進(jìn)一步確認(rèn)和篩選
- 挑取檢出的單細(xì)胞和克隆
- 記錄和輸出實(shí)驗(yàn)結(jié)果
每個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟將顯示在一個(gè)專用的用戶界面中,允許訪問(wèn)相應(yīng)步驟的適當(dāng)數(shù)量的功能和數(shù)據(jù)。與當(dāng)前實(shí)驗(yàn)步驟無(wú)關(guān)的所有選項(xiàng)和功能都對(duì)操作員隱藏,因此降低了復(fù)雜性。
掃描
通過(guò)采用電動(dòng)顯微鏡載物臺(tái)的高分辨率相機(jī)自動(dòng)掃描含有樣品的微孔板和培養(yǎng)皿。從包含常見(jiàn)商用微孔板規(guī)格到創(chuàng)建定制化規(guī)格的微孔板庫(kù)中選定適用的板型。如有需要,可方便地添加其他規(guī)格微孔板、培養(yǎng)皿或玻片。
根據(jù)應(yīng)用需求,可在明場(chǎng)、相差或高達(dá)6個(gè)熒光通道中進(jìn)行掃描。從相機(jī)設(shè)置(曝光時(shí)間)到硬件設(shè)置(濾光片設(shè)置)和照明參數(shù)范圍內(nèi)的所有成像參數(shù),均存儲(chǔ)在預(yù)定義的成像配置中。這允許通過(guò)簡(jiǎn)單的鼠標(biāo)點(diǎn)擊切換不同的成像設(shè)置。對(duì)于掃描,可以選擇預(yù)定義成像配置的自由組合,以通過(guò)各種通道和照明方法采集多光譜圖像。
分析和檢測(cè)
在該步驟中,分析所有存儲(chǔ)的圖像,并根據(jù)操作員定義的參數(shù)自動(dòng)檢測(cè)靶細(xì)胞和克隆。
對(duì)于每個(gè)記錄通道中檢測(cè)到的每個(gè)細(xì)胞或克隆,軟件會(huì)計(jì)算一組形態(tài)學(xué)測(cè)量參數(shù),如面積、直徑、形狀、球度(圓度)和其他參數(shù)。使用這些參數(shù)上的濾光門可以過(guò)濾分析結(jié)果,從而僅特異性地檢測(cè)靶細(xì)胞和集落。
用戶友好的預(yù)覽功能允許實(shí)時(shí)驗(yàn)證和調(diào)整分析設(shè)置。
所有參數(shù)均可保存為預(yù)定義的分析設(shè)置,可允許對(duì)標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行簡(jiǎn)單的常規(guī)分析。
確認(rèn) (可選)
在分析過(guò)程中,軟件會(huì)生成含所有檢測(cè)對(duì)象的列表,以顯示每個(gè)檢測(cè)細(xì)胞或克隆的所有選定測(cè)量參數(shù)。需要時(shí),操作員可以通過(guò)應(yīng)用額外的數(shù)值過(guò)濾器或預(yù)覽圖像庫(kù)中被檢測(cè)細(xì)胞的圖像來(lái)修訂這些列表。還可以通過(guò)直接在屏幕上選擇目標(biāo)對(duì)象,將附加項(xiàng)添加到選擇列表中。
挑取
CellCelector 的挑取過(guò)程十分溫和,挑取的細(xì)胞或克隆具有較高的存活率。因此,CellCelector 適合進(jìn)一步的細(xì)胞培養(yǎng)、單細(xì)胞克隆或各種分子分析方法。
CellCelector 軟件允許操作員訪問(wèn)多種挑取參數(shù)(如吸氣和分配速度、體積、挑取高度等)。且允許單獨(dú)調(diào)整和優(yōu)化這些參數(shù),以便從單個(gè)細(xì)胞、懸浮或半固體培養(yǎng)基至貼壁細(xì)胞克隆中獲得理想的挑取結(jié)果。
優(yōu)化這些參數(shù)不僅可以從標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞培養(yǎng)皿或孔板中挑取對(duì)象,還可以從膜、過(guò)濾器或顯微鏡載玻片中挑取對(duì)象。
記錄
在軟件的記錄頁(yè)列出完整的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)并記錄 GLP 合規(guī)性??梢钥焖?、輕松地導(dǎo)出所有數(shù)據(jù),以便進(jìn)行記錄和存檔。
每一個(gè)被檢測(cè)/捕獲的對(duì)象都可以通過(guò)其唯一的ID進(jìn)行識(shí)別,并可以在整個(gè)過(guò)程中從源板到轉(zhuǎn)移終板進(jìn)行完整的追蹤。
所有捕獲的細(xì)胞和克隆的圖像和數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)以及捕獲前后的顯微高質(zhì)量數(shù)據(jù)圖像都存儲(chǔ)在 CellCelector軟件數(shù)據(jù)庫(kù)中。每個(gè)細(xì)胞的源板位置和轉(zhuǎn)移終板位置記錄在同一列表中。這樣,在下游分析后,可以很容易地重新訪問(wèn)成像和挑取數(shù)據(jù)(例如.PCR或培養(yǎng)數(shù)據(jù))。
CellCelector 軟件的優(yōu)勢(shì)和功能
- 通過(guò)創(chuàng)建自己的協(xié)議和對(duì)所有參數(shù)的開(kāi)放訪問(wèn),完全適合研究和開(kāi)發(fā)應(yīng)用程序需求
? ? - 通過(guò)圖像化的實(shí)驗(yàn)流程來(lái)簡(jiǎn)化操作,易用使用,并利用程序標(biāo)準(zhǔn)化進(jìn)行日常工作
? ? - 通過(guò)高質(zhì)量成像、大量圖像和參數(shù)快速處理分析,以及靈敏準(zhǔn)確的細(xì)胞捕獲,實(shí)現(xiàn)高度靈活性
? ? - 記錄完整且符合 GLP 的整個(gè)過(guò)程
? ? - 跟蹤每個(gè)對(duì)象從源板到終板的數(shù)據(jù)
? ? - 用戶可自定義導(dǎo)出所有實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),用于后續(xù)記錄和存檔
? ? - 賽多利斯軟件開(kāi)發(fā)團(tuán)隊(duì)會(huì)根據(jù)客戶需求和建議不斷改進(jìn)軟件