COVID-19 精選文獻
Incucyte? 文獻
https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1009165
Mor, M. et al. Multi-clonal SARS-CoV-2 neutralization by antibodies isolated from severe COVID-19 convalescent donors. PLoS Pathog 17(2): e1009165. 2021.
SARS-CoV-2 抗體、免疫細胞與疾病嚴重程度之間的關(guān)系尚不明確。本研究分析了重癥和輕癥 SARS-CoV-2 獻血者恢復期血液中抗體應答的細胞、分子和功能特征。當使用分離得到的抗 SARS-CoV-2 抗體時，作者通過 Incucyte? S3 活細胞分析系統(tǒng)監(jiān)測了細胞死亡和細胞間融合。數(shù)據(jù)表明，重癥 COVID-19 觸發(fā)獨特的抗體應答，可以為抗體雞尾酒療法提供信息。
主要發(fā)現(xiàn)：
- 重癥獻血者抗 SARS-CoV-2 IgG 相對于刺突蛋白受體結(jié)合域 (RBD) 的滴度更高，并且 B 細胞擴增更高。
- 在活細胞分析中，分離得到的 22 個單克隆抗體中有 6 個有效地中和了活病毒并阻止了合胞體的形成。肽庫、計算方法和突變分析一同揭示了抗體結(jié)合的機制。
- 分離的中和抗體雞尾酒療法阻止了細胞培養(yǎng)中病毒的復制。
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.17.156455v1.abstract
Stukalov, A. et at. Multi-level proteomics reveals host-perturbation strategies of SARS-CoV-2 and SARS-CoV, 2020. doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.17.156455
開發(fā)針對 SARS-CoV2 的治療方法需要更好地了解病毒蛋白與宿主蛋白之間的相互作用。這項蛋白質(zhì)組學研究表征了 SARS-CoV-2 及相關(guān)冠狀病毒感染中涉及的病毒 - 宿主中蛋白質(zhì)相互作用和信號轉(zhuǎn)導過程。這些數(shù)據(jù)揭示了可以通過已知藥物調(diào)控從而改變冠狀病毒感染過程的獨特和常見的通路。
主要發(fā)現(xiàn)：
- 蛋白質(zhì)組學分析鑒定了 1086 種細胞蛋白與 24 種 SARS-CoV-2 和 27 種 SARS-CoV 引誘蛋白之間的 1484 種相互作用，表明它們涉及一系列生物學過程。
- 綜合數(shù)據(jù)顯示，應激和 DNA 損傷反應、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)和細胞連接組織等關(guān)鍵途徑均參與了感染過程。
- 使用 48 種臨床批準的化合物對這些通路進行靶向選擇性分析，識別出對 SARS-CoV2 具有顯著抗病毒活性的激酶和基質(zhì)金屬蛋白酶抑制劑。作者使用了 Incucyte? S3 活細胞分析系統(tǒng)進行延時熒光病毒檢測。
iQue? 文獻
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33514825/
Dogan, M. et al. SARS-CoV-2 specific antibody and neutralization assays reveal the wide range of the humoral immune response to virus. Commun Biol. 4(1):129. 2021.
了解 COVID-19 抗體響應的數(shù)量、質(zhì)量和持續(xù)時間對疫苗的開發(fā)至關(guān)重要。本研究通過開發(fā)高度敏感和特異性的 SARS-CoV-2 抗體及抗體中和檢測方法，填補了該領(lǐng)域中的一個重大空白。在 iQue? 高通量流式細胞儀上進行 SARS-CoV-2 蛋白抗體結(jié)合篩查。作者用該試驗證明了 COVID-19 患者的多種體液免疫應答。
主要發(fā)現(xiàn)：
- 基于微球的熒光免疫法能夠在稀釋 10 萬倍的 SARS-CoV-2 受試者血漿樣本中準確檢測出 SARS-CoV-2 刺突蛋白或核衣殼蛋白特異性 IgG 抗體。該方法還可檢測到其他抗體亞型。
- 使用了 SARS-CoV-2 刺突蛋白假病毒的穩(wěn)定檢測方法在稀釋倍數(shù)高達 10000 倍的 COVID-19 和恢復期血漿中均檢測到了中和作用。
- 檢測顯示了 COVID-19 患者體液免疫應答的差異；具體來說，重癥患者的抗體和中和滴度是門診或康復期血漿捐獻者的 3000 倍。
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022283620306732
Hattori, T. et al. The ACE2-binding Interface of SARS-CoV-2 Spike Inherently Deflects Immune Recognition. J Mol Biol. 433(3):166748.?2021.
詳細了解 SARS-CoV-2 刺突蛋白及其受體結(jié)合域 (RBD) 的免疫原性表面對于開發(fā)有效疫苗和基于抗體的治療手段至關(guān)重要。本研究利用 RBD 突變體作為表征 COVID-19 患者恢復期血清中抗 RBD 抗體的工具。數(shù)據(jù)顯示，RBD 的 ACE2 相互作用表面的免疫原性低于其他區(qū)域。作者使用先進的高通量流式細胞術(shù) iQue? 系統(tǒng)進行了基于細胞和微珠的結(jié)合檢測。
主要發(fā)現(xiàn)：
- 對恢復期血清中抗體的結(jié)合分析表明，大多數(shù)抗體并不靶向 RBD 的 ACE2 相互作用表面。
- 使用人抗體噬菌體展示文庫進行的無偏向性體外抗體選擇顯示，89% 的克隆體結(jié)合了刺突蛋白，但沒有結(jié)合 RBD 或 ACE2 結(jié)合表面。通過偏向性篩選識別出了靶向 ACE2 結(jié)合表面的抗體。
- 在無偏向性選擇中結(jié)合 RBD 的抗體則優(yōu)先結(jié)合未暴露于天然棘突蛋白三聚體的表面。